在會議前，有資深獸醫師簡單推算「以6,000位執業獸醫師來計算，1天若開立10張購藥證明，而開立1張購藥證明以200元來估算，一年下來會是新台幣43億元的新增費用。」這才提醒了飼主，這些由人力協助登錄與核銷的流程，也是需要支付費用的。
而在前日的會議中，不是沒有人提問相關行政費用要收取多少錢，不過，出席的藥師代表僅先回應「現階段全力協助動物用藥新制順利上路，還沒有計算過或是想到這個問題。」語畢，現場與會人士也難以接續攻防，也留下了一個待解之謎。
同樣的一顆藥，僅僅是外觀標籤從「人類用藥」轉貼成「動物用藥」，不知道門道的一般人會以為藥價應該差不多，但現實答案卻不是這樣，「一旦從人類用藥改標籤為動物用藥，由於市場小很多，產線包裝卻是另外開，藥商給的價格就會不一樣。」親自號召民眾到場外關心草案的中華民國獸醫內科醫學會理事長鍾昇樺對本刊解釋。
再者，「目前人類藥品很多都有健保補助，但是動物用藥是飼主全自費，取得售價自然也會不一樣，應該說，計算結構上就不一樣。」與會人士指出，也就是說，醫師與藥師分工下，希望能更具體掌握藥物流向，但卻不一定可以讓動物藥物價格向人類藥物價格看齊。
種種計算下來，獸醫師普遍認為未來飼主非常有可能得多付費用，不過具體要支付多少還未確知，得由藥師評估給數字，而此點不僅事涉飼主未來荷包得多準備多少錢來支付毛小孩醫療費用，也攸關動物用藥新制能否順利推動上路。
