針對外界批評南部逢雨必淹、質疑治水經費到底花去哪，賴清德說，他要請對中南部治水還不夠了解、每次颱風一定不放棄機會罵中央罵地方預算用到哪的這些朋友，了解實際情況後再做評論。
賴清德說，大台北地區的治水早於全台灣，使用的經費「累計」起來也比較多，安全標準也比較高，所以現在中南部在積極治水的時候，千萬不要一遇到颱風、豪大雨淹水，就來責備中南部治水的錢花到哪。
若以近幾年治水工程的經費來算，說中南部拿比較多、北部拿比較少，然後來批判中南部的治水「我覺得這個是不公平，而且數字也失真。」賴清德說，南台灣治水直到陳水扁時代才開始，若要累計所有治水工程，經費應該要從中央政府一開始在全台灣治水工程所花的預算來看，這樣才公平。
賴清德說，南部治水工程推動後確實有發揮功能，那為什麼還會淹水呢？「是因為超過了保護標準啊！」瞬間強降雨每小時達84毫米或是24小時累積雨量超過500毫米，等於是比莫拉克颱風的雨量還大，都超過台灣中南部的河川保護標準或下水道的通洪標準，所以他希望全國民眾能了解，中央治水預算是全台灣都會去進行，北台灣比較早，中台灣跟南台灣後續要持續，千萬不要颱風一發生，中南部一淹水，就來批評治水計畫。
賴清德強調，中央地方都非常珍惜治水預算並積極投入工程，發揮滯洪效果，「希望全國民眾父老鄉親都能了解，也敬請不了解、然後持續批判的人，能夠進一步清楚知道，不要在南台灣淹水的時候又來批判，情何以堪呀！」
